Afzan dilahirkan dan dibesarkan di Johor Bahru, Johor. Beliau mengakhiri zaman duda pada 1 November 2011 bersama wanita pilihan Hasliza Md Sharasan. Perkahwinan bersama Hasliza merupakan yang kedua bagi Afzan selepas empat tahun menduda.[3] Anaknya Muhammad Haikal merupakan salah seorang pelapis muda bagi pasukan belia bola sepak JDT dan turut dikurniakan seorang puteri bernama Anggun Nurcarissa.[4]