Alel bermaksud bentuk-bentuk lainan bagi
gen yang sama ataupun
lokus genetik (lazimnya kelompok gen).
[1][2] Alel merupakan bentuk alternatif bagi suatu gen untuk suatu sifat yang membuahkan kesan-kesan yang berbeza. Adakalanya alel yang berbeza-beza boleh menyebabkan perbezaan dalam
ciri fenotip yang dapat diperhatikan, seperti kelainan pigmentasi. Bagaimanapun, kebanyakan kelainan genetik tidak menimbulkan sebarang perbezaan yang ketara.Kebanyakan
organisma multisel adalah
diploid, iaitu mempunyai dua set
kromosom. Kromosom ini merupakan
kromosom homolog. Organisma diploid memiliki satu salinan dari setiap gen (dan oleh itu satu alel) pada setiap kromosom. Organisme yang kedua-dua alel adalah sama adalah
homozigot, sementara yang berbeza alel-alelnya adalah
heterozigot.Dalam sesebuah
populasi atau
spesies organisma lazimnya terdapat berbilang alel di setiap
lokus dalam kalangan pelbagai individu. Kelainan alel di suatu lokus boleh disukat sebagai bilangan alel (
polimorphisme) yang terdapat, ataupun kadar heterozigot dalam populasi.Misalnya, pada lokus gen bagi
antigen karbohidrat jenis darah ABO pada manusia,
[3] ilmu genetik klasik mengenali tiga alel, iaitu IA, IB, dan IO yang menentukan keserasian
pemindahan darah. Setiap individu memiliki satu daripada enam
genotip berkemungkinan (AA, AO, BB, BO, AB, dan OO) yang menghasilkan salah satu daripada empat
fenotip yang mungkin, iaitu: "A" (dihasilkan oleh genotip homozigot AA dan heterozigot AO), "B" (dihasilkan oleh genotip homozigot BB dan heterozigot BO), heterozigot "AB", dan homozigot "OO". Kini diketahui bahawa setiap alel A, B, dan O sebenarnya adalah sekelompok alel dengan pelbagai jujukan DNA yang menghasilkan protein dengan sifat-sifat yang seiras: diketahuinya lebih daripada 70 alel pada lokus ABO.
[4] Seseorang yang berjenis darah "A" mungkin heterozigot AO, homozigot AA, atau heterozigot AA dengan dua alel "A" yang berbeza.Istilah "alel" adalah singkatan bagi
alelomorf ("bentuk lain"), yang digunakan pada awal zaman ilmu
genetik untuk menyifatkan bentuk-bentuk kelainan
gen yang dikesan sebagai pelbagai
fenotip. Ia terbentuk dari awalan bahasa Yunani ἀλλήλ- ["allel-"], yang bermaksud "saling" atau "satu sama lain", yang berpunca daripada kata sifat Yunani ἄλλος (allos; seasal dengan Latin "alius") yang bermaksud "lain".