Holberton lahir dengan nama Frances Elizabeth Snyder di Philadelphia, Pennsylvania pada tahun 1917. Holberton belajar bidang kewartawanan kerana kurikulum dalam kewartawanan memaksa beliau dapat pergi lebih jauh.[2] Kewartawanan juga merupakan salah satu dari sedikit bidang yang terbuka bagi kerjaya wanita pada tahun 1940-an.[3] Pada hari pertama kuliah di Universiti Pennsylvania, profesor matematik Holberton bertanya adakah beliau tidak akan lebih baik di rumah membesarkan anak-anaknya.[3]