Biji benih (bahasa Latin:semen) adalah bakal biji (ovulum) dari pokok berbunga yang telah masak. Biji terlindung oleh organ lain (buah, pada angiosperma atau Magnoliophyta) atau tidak (pada Gymnospermae). Dari sudut pandang evolusi, biji merupakan embrio atau tumbuhan kecil yang termodifikasi sehingga dapat bertahan lebih lama pada keadaan kurang sesuai untuk pertumbuhan. (Lihat pergiliran keturunan).