Kontroversi Suruhanjaya Pencegahan Rasuah Malaysia wujud kerana ia adalah pelaksana dan penguatkuasaan undang-undang. Sebagai sebuah suruhanjaya yang ditubuhkan oleh kerajaan, segala tindak-tanduknya diperhatikan oleh rakyat. Persepsi negatif ini bukan baru dan bukan tidak ada bukti. Sejarah menunjukkan Badan Pencegah Rasuah ini telah diubah beberapa kali dan kini dinamakan Suruhanjaya Pencegahan Rasuah Malaysia.