San‘a’ terletak di tengah-tengah tanah tinggi penara Yaman di ketinggian 2,200 m dan dikelilingi oleh beberapa gunung, seperti Jabal Nuqum dan Aiban. Ia mempunyai cuaca sejuk dan kering dan mungkin sedikit bersalji pada musim sejuk. Suhu terlampau yang pernah direkodkan adalah -3.0 °C dan 34.4 °C. Kota ini menerima cuaca yang baik sekitar bulan April hingga Oktober. Kedatangan ribut disebelah petang adalah biasa beserta dengan hujan.

Kota ini terletak kira-kira 370 km ke utara Aden, satu kota bagi pusat ekonomi dan kewangan Yaman.