Nama Amarnah berasal daripada suku Amran yang tinggal di wilayah tersebut dan mengasaskan beberapa penempatan. Nama Mesir purbanya Akhetaten.

(Tapak ini harus dibezakan daripada Tel Amarnah di Syria, bukit kecil dan tapak arkeologi budaya Halaf.[5])

Ahli kaji Mesir Inggeris, Sir John Gardner Wilkinson, melawat Amarnah dua kali pada tahun 1820-an dan mengenal pasti ia sebagai Alabastron,[6] berikutan keterangan daripada pengarang zaman Rom, Pliny (On Stones) dan Ptolemy (Geografi) yang kadangkala bercanggah dengan satu sama lain.[7][8] Namun, beliau tidak begitu yakin dengannya dan mencadangkan Kom el-Ahmar sebagai lokasi alternatif.[9]