Hospital diketuai oleh seorang Pengarah yang menjawat jawatan Pegawai Perubatan gred UD54 dan dibantu oleh para Pegawai Perubatan gred UD41 dan UD44 yang masing-masing bertindak sebagai Penolong Pengarah Hospital. Setiap Pegawai Perubatan diberi tugas mengetuai unit masing-masing. Pentadbiran Pengarah Hospital turut dibantu oleh seorang Penyelia Hospital dari kalangan Penolong Pegawai Perubatan U32.

Pengurusan Hospital Tuaran dilicinkan lagi dengan kewujudan Lembaga Pelawat Hospital Tuaran yang mengandungi semaksima 15 orang ahli lembaga, yang dipilih dari kalangan pimpinan dan ahli parti politik yang memerintah kawasan Parlimen Tuaran dan kawasan-kawasan Dewan Undangan Negeri (DUN) Tamparuli, Sulaman dan Kiulu.