Di Kalinyamatan Terdapat Fasilitas Pendidikan, Yaitu:

Pendidikan Formal:

Sekolah Menengah Pertama

• SMPN 1 Kalinyamatan, di Batukali
• SMPN 2 Kalinyamatan, Damarjati
• SMP Islam Sultan Agung 3, di Kriyan
• SMP Muhamadiyah, di Purwogondo
• MTS Al-Falah, di Margoyoso
• MTS Darul Ulum, di Purwogondo
• MTS Nurul Islam, di Kriyan
• MTS Tasywiqul Banat, di Robayan

Sekolah Menengah Atas:

• SMKN Kalinyamatan, di Batukali
• SMA Islam Sultan Agung 2, di Kriyan
• MA Al-Falah, di Margoyoso
• MA Darul Ulum, di Purwogondo
• MA Nurul Islam, di Kriyan
• MA Tasywiqul Banat, di Robayan

Perguruan Tinggi:

• Akademi Perikanan Kalinyamat, di Kriyan

Pendidikan Non Formal :

• TPQ Baitul Mustaqim, di Robayan
• Madrasah Diniyah Awwaliyah Al-Azhar, di Robayan
• Madrasah Diniyah Wustho Al-Azhar, di Robayan
• Pondok Pesantren Miftahul Ulum, di Robayan
• Pondok Pesantren Al-Quran Ar-Roudloh, di Robayan
• Pondok Pesantren Al-Fatah, di Robayan
• Pondok Pesantren Baiturrochim, di Robayan
• Pondok Pesantren Ash-Shiddqi, di Robayan
• Pondok Pesantren Nailun Najah, di Kriyan
• Pondok Pesantren Al-Falah, di Bakalan
• Pondok Pesantren Al-Hidayah, di Purwogondo
• Pondok Pesantren Rodlatul Huda, di Margoyoso