Sekitar 93 peratus penduduk Azerbaijan adalah penduduk Muslim manakala kira-kira 5 peratus penduduk berpegang kepada Gereja Ortodoks Rusia. Di kalangan majoriti Islam, pemeliharaan agama agak rendah dan identiti Islam lebih cenderung berdasarkan budaya dan etnik daripada agama. Penduduk Islam adalah sekitar 70 peratus Shi'a dan 30 peratus Sunni; perbezaan secara tradisinya tidak ditakrif secara teliti.

Terdapat ramai komuniti Kristian dan Muslim di ibu kota Baku; Pihak berkuasa umumnya membenarkan kumpulan ini untuk beribadah secara bebas.

Islam

Selepas keruntuhan Kesatuan Soviet, semua organisasi keagamaan berpecah dan kemurungan sementara Organisasi Keagamaan Transcaucasia Muslim yang diketuai oleh akhund Allanshukur Pashazade memilih sheykhulislam pada tahun 1980 menguatkuasakan operasi dan cuba menyebarkan pengaruhnya ke seluruh Kaukasus di bawah nama Jabatan Agama Islam Kaukasus. Langkah-langkah untuk melaksanakan percubaan ini dilakukan pada sesi kesepuluh umat Islam Kaukasus yang diadakan di Baku pada tahun 1998. Pembukaan representasi CMD di Georgia dan Dagestan adalah salah satu langkah penting dalam bidang ini.

Kristian

Ortodoks kini diwakili di Azerbaijan oleh gereja-gereja Ortodoks Rusia dan Georgia. Jemaah-jemaah Ortodoks Rusia dikumpulkan di Eparki Baku dan rantau Kaspia.

Gereja Roman Katolik di Azerbaijan adalah sebahagian daripada Gereja Katolik Roma di seluruh dunia di bawah pimpinan rohani Paus di Rom. Ianya adalah salah satu negara yang paling sedikit Katolik di dunia dari segi bilangan penganut dengan hanya 400 yang setia daripada jumlah penduduk yang melebihi tujuh juta. Kira-kira separuh penganut terdiri daripada orang asing yang bekerja sebagai diplomat atau bekerja untuk syarikat minyak.[8]

Judaisme

Terdapat tiga komuniti Yahudi yang berasingan iaitu (Yahudi Gunung, Yahudi Ashkenaz, dan Yahudi Georgia) di Azerbaijan yang berjumlah hampir 16,000. Daripada jumlah itu, 11,000 orang Yahudi Gunung, dengan kepadatan 6.000 di Baku dan 4,000 di Guba, 4,300 orang Yahudi Ashkenaz yang kebanyakannya tinggal di Baku dan Sumgayit dan 700 orang Yahudi Georgia.

Majusi

Sejarah Majusi di Azerbaijan kembali ke milenium pertama SM. Bersama dengan wilayah lain dari Empayar Persia. Azerbaijan tetap menjadi negara yang didominasi oleh negara Zoroaster sehingga invasi Arab pada abad ke-7. Nama Azerbaijan bermaksud "Tanah Api Abadi" di Persia Tengah, sebuah nama yang dikatakan memiliki hubungan langsung dengan Majusi.[9]

Hari ini agama, budaya, dan tradisi Majusi tetap dihormati di Azerbaijan dan Novruz terus menjadi hari perayaan utama di negara ini. Majusi telah meninggalkan bekas yang mendalam dalam sejarah Azerbaijan. Jejak agama masih terlihat di Atashgah, Ramana, Khinalyg, dan Yanar Dag.