Jawatan ini diwujudkan selepas kawasan Parlimen Pagoh diwujudkan selepas kawasan Parlimen Muar Dalam dibubarkan. Syed Nasir Syed Ismail telah terpilih sebagai Ketua UMNO Bahagian Pagoh yang pertama. Selepas kemasukan Othman Saat ke UMNO Bahagian Pagoh, beliau telah memenangi jawatan tersebut.

Pada tahun 1985, Tan Sri Muhyiddin Yassin telah masuk bertanding untuk jawatan tersebut dan memenanginya[2] sehingga dipecat pada tahun 2016 lalu. Beliau menjadi Ketua UMNO Bahagian Pagoh yang paling lama memegang jawatan tersebut.