Kristian di Indonesia adalah agama minoriti. pada tahun 2018 Kira-kira 18.785.240 juta penduduk Indonesia adalah Protestan dan lebih kurang 7.944.283 juta adalah Katolik. Di wilayah provinsi Papua 95%, Papua Barat 68%, Nusa Tenggara Timur 94%, Sulawesi Utara 67% dan Maluku 50% dan juga kawasan-kawasan lainnya Protestan membentuk mejoriti penduduk agama ini. Kristian Nestoria telah hadir di Indonesia sekarang pada abad ke-10 dan ke-11.[1] Protestan mula dikenalkan oleh Belanda pada abad keenambelas, menyebabkan pengaruh Calvinist dan Lutheran. Penganut Roman Katolik pertama tiba di 1534, di kepulauan Maluku. Mereka adalah Portugis, yang dikirimkan untuk penjelajahan. Francis Xavier, seorang mubaligh Roman Katolik dan penemu sama Jesuit Order bekerja di kepulauan Maluku dari 1546 hingga ke 1547. Julius Darmaatmadja adalah satu-satunya kardinal terkini di Indonesia. Dia adalah archbishop Jakarta.