Maluku FC didirikan pada 27 Januari 2021, tim ini bertujuan memajukan bola sepak Maluku yang telah lama vakum dari kompetisi bola sepak Indonesia. Salah satu bentuk keseriusan Maluku FC dalam memajukan sepak bola di Maluku, yakni dengan ketersediaan infrastruktur pendukung klub yang saat ini telah dimiliki, salah satunya Bus Maluku FC.