Nintama Rantarou mempunyai banyak lagu yang disusulkan bersama sebagai runut bunyi dan sebagai lagu ketika kredit pembukaan dan penutup. Lagu pembukaan bagi anime ini hanya satu sahaja iaitu Yuuki 100% (Keberanian 100%) yang dinyanyikan asalnya oleh Hikaru Genji. Lagu penutup pula terdapat pelbagai lagu yang diubah dari musim ke musim, hari ke hari, minggu ke minggu, tahun ke tahun.