Yun Myung-hye dilahirkan pada 10 Ogos 1491 pada tahun-tahun terakhir pemerintahan Raja Seongjong. Ayahnya, Yun Yeo-pil, ialah anggota suku Papyeong Yun dan ibunya anggota suku Suncheon Park (순천 박씨, 順天 朴氏). Baginda anak kelima daripada enam adik-beradiknya dan yang keempat daripada lima adik-beradiknya, dan seorang abangnya. Melalui ayahnya, Yun Myung-hye ialah sepupu ketiga Permaisuri Munjeong dan merupakan cucu dari Permaisuri Jeonghui.

Memandangkan ibunya meninggal pada usia muda setelah melahirkan adik perempuannya, ibu saudaranya, Puteri Dalaman Besar Seungpyeong dari suku Suncheon Park, telah membesarkannya sebagai pengganti ibunya. Walaupun Yun Yeo-pil tidak berkahwin lagi, Yun Myung-hye mempunyai adik perempuan yang lebih muda. Tetapi keturunan keluarga atau ayahnya tidak menyebutkan catatan mengenai gundik atau ibu kedua selain nama dan tahun kelahiran adik perempuannya

Kakak sulung Myung-hye, Puan Besar Papyeong, mengahwini Putera Deokpung (sepupu tirinya), yang merupakan putera kepada Putera Besar Wolsan (anak kepada Permaisuri Insu) dan anak tiri ibu saudaranya.

Pada tahun 1506 (semasa tahun pertama Raja Jungjong memerintah), Yun Myung-hye telah memasuki istana sebagai gundik untuk Raja dalam daftar istana dalaman, diberi gelaran Suk-ui (숙의, 淑儀), peringkat kedua muda gundik Raja. Setelah Permaisuri Dangyeong digulingkan, Yun Suk-ui telah dipilih daripada gundik yang lain, dan telah menjadi Permaisuri Ratu Joseon.

Pada 13 Jun 1511, Permaisuri melahirkan Puteri Hyohye, puteri sulung Raja Jungjong, dan pada 10 Mac 1515, baginda kemudian melahirkan seorang putera, Yi Ho, bakal Raja Injong.