Selepas kerajaan menuduh Ayombekov dan rakan sejenayah , beliau merasakan ketidakadilan berlaku. Komunikasi telefon dan internet telah dipotong di bandar Khorog, Gorno-Badakhshan .Laman web yang popular di sanan tujrut ditutup.Kakitangan kumpulan bantuan antarabangsa telah dipindahkan kerana bimbang peperangan akan merebak dengan cepat. Sekatan jalan raya telah di setiap penjuru bandar bagi mengekang pertempuran dari merebak.

Pasukan tentera Tajikistan bergerak ke jalan-jalan di Khorog. Ayombekov meanggarkan bahawa seramai 800 tentera Tajikistan telah dikerahkan ke kawasan itu. Penduduk melihat kereta perisai dan helikopter tempur berlegar di udara.

Televisyen milik kerajaan melaporkan bahawa 23 askar telah cedera, tetapi tiada askar atau orang awam telah terbunuh. Laporan mangsa berbeza-beza. BBC News melaporkan sekurang-kurangnya 12 askar dan 30 militan telah dibunuh.Tetapi sumber hospital menyatakan lebih 100 anggota tentera dan 100 orang awam mati. Associated Press melaporkan dua puluh tentera telah dibunuh, manakala ketua pendakwa tentera, Khairullo Saidov, cedera dikaki.Radio Free Eropah / Radio Liberty melaporkan bahawa penembak tepat telah membunuh sekurang-kurangnya enam orang awam, termasuk kanak-kanak. Al Jazeera melaporkan 12 terkorban dan 30 pemberontak mati, serta lebih daripada 20 anggota tentera yang cedera.

Presiden Rakhmon mengarahkan operasi tentera dihentikan. Komander pemberontak dikatakan telah bersetuju berkompromi dan menggesa semua kumpulan militan Gorno-Badakhshan untuk melucutkan senjata. Reuters melaporkan bahawa Menteri Pertahanan Sherali Khairulloyev menawarkan pengampunan kepada semua pemimpin militan yang menyerah diri.