Semasa gerhana India agung 1868, Janssen turut menunjukkan sifat gas bagi prominences merah, dan mencipta kaedah bagi memantaunya dalam keadaan siang biasa. Salah satu matlamat penyelidikan spektroskopik adalah bagi menjawab persoalan samaada Matahari mengandungi oksigen atau tidak. Kerja awalan penting adalah penghapusan sepenuhnya penyerapan oksigen pada atmosfera Bumi, dan projek beraninya bagi mendirikan pemantauan di kemuncak Mont Blanc dicetuskan oleh pemahaman kelebihan yang didapati dengan mengurangkan ketebalan udara dari masa pemantauan perlu dilakukan. Observatori, asanya yang diletakkan dalam salji yang kelihatannya menutup puncak pada kedalaman sepuluh meter, telah dibina pada September 1893, dan Janssen, sungguhpun telah berusia enam puluh sembilan tahun, membuat pendakian dan menghabiskan masa selama empat hari membuat pemantauan.

Pada 1875, Janssen dilantik sebagai pengarah observatori astrofizik baru yang ditubuhkan oleh kerajaan Perancis di Meudon, dan berjalan ke sana pada tahun 1876 bagi mengambil gambar. Sejumlah siri gambar suria mengkagumkan terkumpul dalam Atlas de photographies solaires (1904) agungnya. Jilid pertama Annales de l'observatoire de Meudon diterbitkannya pada tahun 1896.

Janssen meninggal di Meudon dan dikebumikan di Perkuburan Père Lachaise di Paris.

Kawah hentaman di Marikh dan bulan dinamakan sempena menghormatinya.

Rencana ini menggabungkan teks daripada Ensiklopedia Britannica Edisi Ke-11, sebuah terbitan yang kini di domain awam.