Pada September 2013, ketika masjid itu masih dalam pembinaan, pengkritik timbul mengenai rancangan untuk menyiarkan saluran televisyen rasmi TV Al-Aqsa yang dikendalikan Hamas di pusat media masjid, Hamas menjadi disenaraihitamkan sebagai organisasi pengganas dalam Kesatuan Eropah (yang Denmark adalah ahli).[3]

Pada Jun 2014, Majlis Islam Denmark membuka Masjidil Haram Copenhagen (secara rasmi Pusat Tamadun Hamad Bin Khalifa, selepas Emir Qatar Hamad bin Khalifa Al Thani), masjid terbesar di negara ini , dan yang pertama dengan minaret. Qatar menyediakan $27 juta untuk membiayai pembinaan, yang menyebabkan Parti Rakyat Denmark menyatakan kebimbangan mereka tentang kemungkinan campur tangan Qatar dalam hal ehwal dalam negeri Denmark.[4] Keluarga diraja Denmark dan menteri kerajaan telah dijemput untuk menghadiri perasmian tetapi menolak jemputan itu, dengan hanya timbalan datuk bandar bagi isu sosial Copenhagen Jesper Christensen yang hadir.[5]

Telah dipersetujui dengan majlis perbandaran Copenhagen bahawa menara itu tidak akan digunakan untuk menyiarkan azan.[6]

Kumpulan Hentikan Islamisasi Denmark telah merancang untuk membantah di hadapan bangunan itu pada hari pembukaannya, tetapi telah diharamkan oleh pihak polis.[7]

Pada tahun 2020, akhbar Berlingske melaporkan bahawa masjid itu telah menerima 227 juta mahkota Denmark (lebih daripada 23 juta euro) daripada pelabur di Qatar.[8]