Sultan Ismail telah berkahwin sebanyak dua kali iaitu dengan:

• Sultanah Aminah binti Ungku Ahmad berkahwin dengan Sultan Ismail pada 30 Ogos 1922.[1] Kemudian baginda sultanah mangkat pada tahun 1976 akibat kemalangan jalanraya di Muar pada tahun 1976. Baginda berdua dikurniakan 7 orang putera dan 3 puteri dimana beberapa daripadanya hidup sehingga dewasa:
• Tunku Abdul Jalil (1924-1925)
• Tunku Kalthum Maimunah (1927-1929)
• Tunku Abdul Rahman (1929-1932)
• Tunku Mahmud Iskandar (Sultan Johor) (1932-2010)[2][3]
• Tunku Abdul Rahman (1934-1989) (Tunku Bendahara Johor) [4]
• Tunku Helen (1937-1937)
• Tunku Maimunah (1939-2012)[2]
• Sultanah Nora binti Tengku Panglima Raja Tengku Ahmad merupakan kerabat diraja Kelantan yang telah berkahwin dengan Sultan Ismail pada bulan Oktober 1978.[5]