Wong mempunyai seorang abang dan dua orang adik. Abangnya merupakan seorang doktor, dan tinggal di New Zealand, dan dua orang adik masih di Sarawak, Malaysia, seorang bekerja dalam bidang penjagaan kesihatan, seorang berkhidmat dalam bidang pendidikan.

Wong dan isterinya melahirkan empat anak, tiga perempuan dan seorang lelaki. Pada 10 Februari 2019, anak lelaki Wong, Andrew, telah meninggal dunia.[4]