Banjir ini mencetuskan konflik politik kerajaan negeri Kedah. Menteri Perumahan dan Kerajaan Tempatan dan MP Alor Setar, Chor Chee Heung, Barisan Nasional, mengkritik kerajaan negeri Kedah atas kelambatan pemberian bantuan kepada mangsa banjir. Bertambah buruk lagi apabila rumahnya di Alor Setar juga dilanda banjir.[13][14] Timbalan Perdana Menteri Malaysia, Tan Sri Muhyiddin Yassin menjelaskan bahawa kerajaan Negeri bertanggungjawab dalam membantu mangsa-mangsa banjir.[15] Menteri Besar Kedah pula menyatakan bahawa kerajaan negeri bertindak pantas dalam isu ini serta bantuan berupa RM 300,000 telah disumbangkan kepada mereka yang terjejas dalam banjir.[11] Sultan Kedah Sultan Abdul Halim menitahkan agar perselisihan politik diketepikan dalam usaha membantu mangsa banjir.[16]