Kerajaan perbandaran di bandar ini berstruktur sekitar majlis yang terdiri daripada datuk bandar dan sepuluh majlis dipilih menggunakan sistem wad. Datuk Bandar semasa di bandar ini Clifford J. Lee.

Charlottetown juga mempunyai 7 kerusi (30%) dalam Dewan Undangan Pulau Prince Edward, walaupun ia harus diperhatikan bahawa beberapa daerah pilihan raya menduduki kawasan luar bandar bersebelahan yang tidak berada dalam sempadan di bandar ini. Bandar ini mempunyai satu kerusi di Dewan Rakyat; timbalan semasa Sean Casey (Liberal).