Keju fondue terdiri dari campuran keju, wain putih dan perasa. Periuk caquelon disapu dengan seulas bawang putih yang dipotong terlebih dahulu. Wain putih dicampurkan dengan tepung jagung dipanaskan dalam periuk ini, dan seterusnya parutan keju ditambahkan ke dalamnya dan kacau sehingga cair. Campuran dikacau sentiasa sementara periuk caquelon itu memanas.

Apabila kuah fondue tersebut siap, ia dicicah bersama kepingan roti dengan menggunakan sejenis garfu panjang.