Komuniti Islam di Kanada diwakili oleh beberapa pertubuhan:

• Komuniti Islam Ahmadiyyah Kanada.
• Canadian Islamic Congress, yang mengaku mewakili golongan arus perdana ortodoks dalam komuniti dan mendapat sokongan kebanyakan masjid
• Ahlul Bayt Assembly of Canada.
• Muslim Association of Canada (MAC) yang mengadakan pengasasannya berakar dalam ideologi Islam tradisional dengan suatu fokus pada penggunaan dinamik dalam konteks sosio-politik Kanada kini.
• Canadian Council on American-Islamic Relations (CAIR-CAN) yang kini menjadi salah satu dari peguambelaan utama dan kebebasan sivil di belah pihak komuniti Islam,
• Muslim Canadian Congress, suatu kumpulan progresif dan liberal yang diasaskan pada 2002,
• Canadian Muslim Union suatu lagi kumpulan liberal yang dipisahkan dari MCC,
• dan juga pertubuhan-pertubuhan besar lain seperti
  • Islamic Society of North America (ISNA)
  • dan Islamic Circle of North America (ICNA).

Meskipun, aspek utama komuniti Islam di Kanada adalah tersebarnya persatuan-persatuan bandar seperti Muslim Council of Montreal contohnya, Toronto's Council, yang menguruskan khususnya dengan isu-isu berkaitan dengan komuniti itu dalam bandar dan mereka menyokonh persatuan-persatuan negara.

Banyak dari pertubuhan-pertubuhan ini bukan pertubuhan-pertubuhan akar rumput, kecuali MAC, tetapi adalah anak lembaga dan lembaga koordinasi di antara persatuan-persatuan tempatan.

Ini adalah hanya sesetengah dari pertubuhan utama dalam komuniti Islam Kanada. Apabila komuniti ini semakin besar dan pelbagai dengan 60 lebih kumpulan etnik budaya pelbagai pertubuhan berlanjutan bermuncul apabila mereka mencari untuk menemu keperluan anggota-anggota komuniti.

Permulaan-permulaan dipimpin pelajar biasanya disokong baik dan kejayaan, termasuk upacara-upacara tahunan seperti MuslimFest dan persidangan Reviving the Islamic Spirit, upacara Islam terbesar di Kanada.