Kasein mengandungi kandungan sisa prolina yang tinggi yang tidak berinteraksi antara satu sama lain. Ia juga tidak mempunyai jambatan disulfida, oleh itu struktur tertier yang diperhatikan agak sedikit. Kasein bersifat hidrofobik yang menjadikannya kurang larut dalam air. Ia dijumpai di dalam susu sebagai ampaian partikel, dipanggil misel kasein, yang menunjukkan persamaan yang kurang dengan misel jenis surfaktan kerana bahagian hidrofiliknya terapung di permukaan dan berbentuk bulat. Bagaimanapun, dalaman misel kasein jauh lebih terhidrat berbanding misel jenis surfaktan. Partikel kasein dalam misel dihubungkan oleh ion kalsium dan interaksi hidrofobik. Mana-mana beberapa model molekul boleh bertanggungjawab atas pengesahan kewujudan kasein dalam misel; [4] salah satu daripada model ini mencadangkan misel nukleus dibentuk oleh beberapa submisel, periferinya terdiri dari mikrovelositi κ-casein.[5][6] Satu model lain menunjukkan nukleusnya dibentuk oleh gentian halus yang saling berhubung.[7] Model yang terbaru[8] mencadangkan sambungan kembar antara molekul kasein yang membolehkan pengelan berlaku. Ketiga-tiga model ini menganggap misel sebagai partikel koloid yang dibentuk oleh agregat kasein dibungkus dalam molekul κ-kasein yang mudah larut.