MKPN merupakan sebuah badan yang mempunyai peranan dan tanggungjawab sama dengan Majlis Perpaduan Negara yang ditubuhkan oleh Majlis Gerakan Negara (Mageran) selepas berlakunya Peristiwa 13 Mei pada 13 Mei 1969. Majlis itu telah dibubarkan serentak dengan pembubaran Mageran berikutan pemulihan kerajaan demokrasi berparlimen pada 23 Februari 1971 dan sebagai ganti sebuah badan baru iaitu Majlis Penasihat Perpaduan Negara telah ditubuhkan.

Majlis itu kemudiannya dipengerusikan sendiri oleh Perdana Menteri Tun Abdul Razak Hussein dan dianggotai seramai 51 ahli yang terdiri daripada pelbagai kaum dengan mengekalkan peranan Majlis Perpaduan Negara. Kemudian, pada 15 September 2011, Perdana Menteri mengumumkan proklamasi darurat yang telah diisytiharkan dahulu ditamatkan penguatkuasaannya.[3]