Tidak banyak yang diketahui tentang sejarah silam Matsumoto. Dia berasal daripada Rukongai dan diselamatkan oleh Ichimaru Gin semasa dia masih kecil lagi; mereka berdua kemudiannya menjadi sahabat baik. Dalam satu bab yang ringkas daripada manga, Matsumoto pernah sekali disoal oleh Ichimaru tentang tarikh lahirnya semasa dia masih kecil lagi. Dia menjawab bahawa dia tidak mengetahui tarikh lahirnya kerana sejak dahulu lagi dia hidup bersendirian. Ini mungkin sekali bermaksud bahawa dia merupakan anak yatim sebaik sahaja dia dilahirkan. Apabila Ichimaru Gin mendengar jawapannya, dia berkata bahawa hari lahirnya akan jatuh pada hari mereka bertemu (pada hari dirinya tidak lagi bersendirian).

Kejadian-kejadian yang membawanya menjadi seorang shinigami, mahupun bagaimana dia dijadikan leftenan dalam Divisyen ke-10 masih menjadi tanda tanya, akan tetapi Matsumoto didedahkan telah memegang jawatannya lebih lama berbanding kapten terkininya, iaitu Hitsugaya Tōshirō. Matsumoto pertama kali bertemu dengan kaptennya di Rukongai apabila mereka berdua berjumpa satu sama lain. Menyedari bahawa kuasa Hitsugaya adalah kuat, dan kesannya terhadap seorang perempuan tua yang tinggal bersama budak lelaki itu, Matsumoto telah berjaya menyakinkan Hitsugaya untuk menjadi seorang shinigami supaya dia dapat mengawalnya.[1]