Muzium Louvre terlibat dalam kontroversi yang mengelilingi hak milik budaya dirampas sewaktu Perang Dunia II oleh Nazi dan di bawah Napoleon I. Selepas kedudukan Nazi, lebih daripada 60,000 rencana telah dipulangkan ke Perancis. Hampir 2,000 barang yang tidak mempunyai hak milik jelas dan telah didakwa oleh warga Israeli dan orang Yahudi telah ditahankan oleh muzium-muzium Perancis, termasuk Muzium Louvre. Pada 1997, Perdana Menteri Alain Juppé memulakan Jawatankuasa Mattéoli, diketuai oleh Jean Mattéoli, untuk menyiasat hal ini dan "menurut dengan kerajaan[,] Muzium Louvre berlanjut memegang 678 keping seni karya [didakwa]."[69] Kempen Napoleon memerlukan keping Itali dan Eropah Utara dan antikuiti telah diambil sewaktu penggalian, khususnya di Mesir dan Timur Dekat. Pentadbiran Muzium Louvre telah berdebat dengan kegemaran untuk menahan barang-barang ini sungguhpun diminta oleh negara-negara sumber untuk pengembalian mereka. Muzium ini menyertai sesi penimbangtaraan yang dipegang melalui Jawatankuasa UNESCO pada Promoting the Return of Cultural Property to Its Countries of Origin.[70]

Pada Oktober 2009 ia telah mengumumkan rancangan McDonalds untuk membuka sebuah restoran di pusat beli-belah muzium. [71] Ini telah ditemukan dengan banyak kontroversi.