Kota ini dimulai pada tahun 1889 ketika status rasminya menjadi sebuah bandar di Jepun. Seratus tahun lebih kemudian, status ini berkembang menjadi bandar wilayah utama pada tahun 1996. Perkembangan kota Niigata mencapai puncaknya sembilan tahun kemudian ketika pada tanggal 21 Mac 2005 apabila digabungkan dengan 12 pekan di sekitarnya dan kemudian digabungkan lagi dengan bandar Maki pada tangal 10 Oktober 2005.