Paus Bonifatius IX (Bahasa Latin: Bonifatius IX; Bahasa Itali: Bonifacio IX; C. 1350-1 Oktober 1404, dilahirkan Pietro Tomacelli[1]) adalah ketua Gereja Katolik dari 2 November 1389 hingga kematiannya. Beliau adalah Rom Kedua paus daripada Perpecahan Barat.[2] Pada masa ini Pihak Menuntut Avignon, Clement VII dan Benedict XIII, mengekalkan Curia Rom di Avignon, di bawah perlindungan monarki Perancis. Beliau adalah paus terakhir hingga kini yang mengambil gelar kepausan "Bonifatius ".