Sejarah Singapore Airlines berhubung kait dengan Sejarah Penerbangan Malaysia kerana kedua-dua penerbangan berasal dari akar yang sama. Ia bermula pada tahun 1947, dimana Malayan Airways ditubuhkan. Seiring dengan kemerdekaan Malaysia, penerbangan ditukar menjadi Malaysian Airways. Kemerdekaan Singapura membawa kepada perubahan nama penerbangan ini kepada Malaysia-Singapore Airlines (MSA). Kerana perbezaan pendapat antara kerajaan Malaysia dan Singapura, maka MSA berpecah kepada dua mengikut negara masing-masing. Maka, terbentuklah Singapore Airlines bagi Singapura dan Sistem Penerbangan Malaysia bagi Malaysia.