Tunku Burhanuddin dikenali sebagai bapa kepada permaisuri Negeri Sembilan. Ketiga-tiga puterinya berkhidmat sebagai Tunku Ampuan (gelaran bagi permaisuri Yang di-Pertuan Besar).

Puteri sulung baginda, Tunku Kurshiah telah berkahwin dengan Tuanku Abdul Rahman dan merupakan Tunku Ampuan dari tahun 1933. Baginda digantikan sebagai Tunku Ampuan oleh adiknya dan puteri kedua Tunku Burhanuddin, Tunku Ampuan Durah, yang telah berkahwin dengan Tunku Munawir.

Puteri bongsu Tunku Burhanuddin, Tuanku Najihah[2] berkahwin dengan Tuanku Ja'afar. Baginda pernah menjadi Tunku Ampuan Besar Negeri Sembilan dari 1967 hingga 2008, ketika baginda menaiki takhta.

Tunku Kurshiah and Tuanku Najihah juga pernah berkhidmat Raja Permaisuri Agong Malaysia .

Seorang cucunda puteri baginda, Tuanku Bahiyah, anakanda Tunku Kurshiah, merupakan Sultanah Kedah dan pernah juga menjadi Raja Permaisuri Agong. Cucunda putera baginda, Tuanku Muhriz, anakanda Tunku Ampuan Durah kini menjadi Yang di-Pertuan Besar.

Tunku Besar Burhanuddin mangkat pada tahun 1961.