Dua jenis DNase utama yang terdapat pada haiwan dikenali sebagai deoksiribonuklease I (DNase I) dan deoksiribonuklease II (DNase II). Kedua-dua keluarga ini mempunyai subkategori di dalamnya.

Keluarga DNase I

Set pertama DNase ialah DNase I. Keluarga ini terdiri daripada DNase I, DNase1L1, DNase 1L2 dan DNase1L3. DNase I membelah DNA untuk membentuk dua produk akhir oligonukleotida dengan hujung 5'-fosfo dan 3'-hidroksi, dan dihasilkan terutamanya oleh organ sistem pencernaan . Keluarga DNase I memerlukan kation Ca2+ dan Mg2+ sebagai pengaktif, dan diekspresikan secara selektif.[1] Dari segi pH, keluarga DNAses I aktif dalam pH normal sekitar 6.5 hingga 8.

Keluarga DNase II

Set kedua DNAase ialah DNase II. Keluarga ini terdiri daripada DNase II ɑ dan DNase II ꞵ. Seperti DNAase I, DNAase II membelah DNA untuk membentuk dua produk akhir oligonukleotida dengan hujung 5'-hidroksi dan 3'-fosfo. Jenis DNAase ini lebih banyak dinyatakan dalam tisu kerana ekspresi tinggi dalam makrofaj, tetapi ekspresi jenis sel terhad. Tidak seperti DNAase I, mereka tidak memerlukan kation Ca2+ dan Mg2+ sebagai pengaktif.[2] Dari segi pH, keluarga DNAase II diekspresikan dalam pH berasid. Corak belahan DNase II diubah dengan kehadiran dimetil sulfoksida (DMSO) yang memberi kesan ketara kepada struktur DNA.