Endoskopi boleh membabitkan

• Saluran penghadaman saluran pencernaan (GI tract):
  • esofagus, perut dan duodenum (esophagogastroduodenoscopy)
  • usus kecil
  • kolon (kolonoskopi,proctosigmoidoskopi)
  • salur hempedu
    • endoskopicopic retrograde cholangiopancreatography (ERCP), duodenoscope-assisted cholangiopancreatoscopy, intraoperative cholangioscopy
• saluran pernafasan
  • hidung (rinoskopi)
  • saluran pernafasan bawah (bronkoskopi)
• saluran kencing (sistoskopi)
• sistem pembiakan wanita
  • serviks (kolposkopi)
  • uterus (histeroskopi)
  • Tiub Fallopian (Faloskopi)
• Rongga badan yang biasanya tertutup (melalui belahan kecil):
  • Rongga perut atau pelvik (laparoskopi)
  • Bahagian dalam sendi (artroskopi)
  • Organ pada dada (thorakoskopi dan mediastinoskopi)
• Semasa hamil
  • amnion (amnioskopi)
  • fetus (fetoskopi)
• Pembedahan plastik
• Panendoskopi (atau endoskopi bertiga)
  • Gabungan laringoskopi, esophagoskopi, dan bronkoskopi
• Kegunaan bukan perubatan bagi endoskopi
  • Masyarakat perancang dan seni bina mendapati endoskope berguna bagi pra-lihat model skala cadangan bangunan dan bandar (architectural endoskopi)
  • Pemeriksaan dalaman sistem teknikal rumit (boreskop)
  • Endoscopes are also a tool helpful in the examination of improvised explosive devices by bomb disposal personnel.
  • FBI menggunakan endoskopi bagi melakukan pengawasan melalui ruang sempit