Kesan sampingan termasuk kerengsaan kulit.[4] Jika terdedah dalam jumlah yang banyak, loya, sakit kepala, dan sesak nafas mungkin berlaku.[3] Peralatan pelindung disyorkan apabila penggunaan bahan ini, terutamanya dalam kepekatan tinggi.[3] Glutaraldehid berkesan terhadap pelbagai mikroorganisma termasuk spora.[3][17] Glutaraldehid ialah dialdehid.[18] Ia berfungsi melalui beberapa mekanisme.[17]

Sebagai pensterilan yang kuat, glutaraldehid bersifat toksik dan merengsa dengan kuat.[19] Tiada bukti kukuh aktiviti karsinogenik,[20] Walau bagaimanapun, sesetengah pekerjaan yang bekerja dengan bahan kimia ini mempunyai peningkatan risiko terhadap beberapa jenis kanser.[20]