Katipunan mempunyai empat matlamat mereka iaitu:

• untuk membangunkan perikatan kuat di kalangan semua ahli (Katipunero)
• untuk menyatukan orang-orang Filipina menjadi sebuah bangsa yang kukuh;
• untuk meraih kemerdekaan Filipina dengan cara konflik bersenjata (atau revolusi);[5]
• untuk mendirikan sebuah republik selepas kemerdekaan tersebut.[6]