Pada 1959, menyusul semakan Perlembagaan, yang mengakui pemerintahan mandiri Singapura, kedudukan istiadat Yang di-Pertuan Negara menggantikan jawatan Gabenor penjajah British. Di bawah aturan peralihan, gabenor terakhir England, Sir William Goode, menjawat sebagai Yang di-Pertuan Negara, dari 3 Jun sehingga 3 Disember 1959. Dia digantikan Yusof Ishak, yang mengangkat sumpah pada hari yang sama dengan diterimanya bendera, lambang, dan lagu kebangsaan.

Gelaran itu dipertahankan ketika Singapura menjadi negeri ke-14 Malaysia pada 1963, namun pada 9 Ogos 1965, Singapura berpisah dari Malaysia untuk menjadi negara merdeka. Pada 22 Disember pada tahun yang sama, perlembagaan dipinda, mengubah gelaran menjadi Presiden dengan dikuatkuasa berlaku dari tanggal kemerdekaan.