Masyarakat Sikh kecil wujud di Malaysia, yang dibawa oleh British untuk membentuk unit polis. Mereka mengikuti Sikhisme, dan membuka tempat ibadat mereka untuk semua kaum dan jantina. Tiada percutian Sikh telah diisytiharkan sebagai cuti kebangsaan,[12] walaupun terdapat 120,000 di negara ini. Sikh mempunyai, seperti orang Kristian, berada di bawah tekanan untuk tidak menggunakan perkataan "Allah" untuk Tuhan dalam teks keagamaan mereka.[58]

Masyarakat Yahudi kecil terdapat di Pulau Pinang. Orang Yahudi mula-mula berhubung dengan semenanjung Melayu pada abad ke-11 ketika pedagang Yahudi berdagang dengan Kesultanan Kedah dan Langkasuka. Ramai orang Yahudi di Malaysia datang dari Parsi. Selepas revolusi komunis di China, lebih ramai orang Yahudi melarikan diri ke Asia Tenggara. Walau bagaimanapun, komuniti Yahudi merosot, dengan ramai yang berhijrah ke negara-negara seperti Australia. Oleh kerana tidak mempunyai cukup ahli untuk mengadakan beberapa upacara Yahudi, satu-satunya rumah ibadat di Pulau Pinang, yang ditubuhkan pada tahun 1932, telah ditutup pada tahun 1976. Pengebumian terakhir di tanah perkuburan Yahudi Pulau Pinang telah berkembang pada tahun 1978.[59] Pada tahun 1990-an masyarakat telah hilang, dan kini dianggap bahawa hanya ada dua orang Yahudi yang memegang pasport Malaysia.[60]

Kumpulan Bahá'í kecil wujud di Malaysia, dengan ahli-ahli dari masyarakat Cina, Eurasia, India, dan masyarakat adat. Ia diperkenalkan kepada Tanah Melayu oleh pasangan Iran pada tahun 1950, dengan Perhimpunan Rohani Kebangsaan pertama yang dipilih pada tahun 1964.[61] Sebuah komuniti sekitar 2500 Jain di Malaysia, dengan keadaan Ipoh menjadi satu-satunya candi Jain di Asia Tenggara. Kebanyakannya ialah Gujarati, yang dianggap telah tiba di Melaka pada abad ke-15 atau ke-16.[62]

Kepercayaan tradisional/agama rakyat masih diamalkan oleh Orang Asal. Diabaikan sebagai animisme, semisal agama Momolianisme oleh orang Kadazan-Dusun, kepercayaan itu tidak diiktiraf oleh negara sebagai agama. Kepercayaan animistik diturunkan melalui tradisi lisan kerana kekurangan sistem penulisan dalam kumpulan orang pribumi, yang memanggil kepercayaan agama adat (agama tradisional atau adat). Agama yang berbeza agak berbeza, dengan nama dan konsep yang berbeza untuk tuhan tertinggi mereka dan dewa-dewa ghaib yang lain. Kebanyakan kepercayaan banyak dipengaruhi oleh persekitaran, dengan ciri-ciri fizikal seperti gunung, pokok, lembah, sungai yang suci, dan semangat Padi. Hubungan yang erat dengan sifat dipupuk, dan hubungan manusia dan alam adalah bahagian yang kuat dari agama, dengan kegiatan sehari-hari seperti perburuan dan pengumpulan yang mempunyai makna rohani.[63]