Tuntasnya, Artemia biarpun banyak jumlahnya, namun sesetengah populasi dan spesies setempat menghadapi ancaman, terutamanya daripada kehilangan habitat kepada spesies-spesies asing yang diperkenalkan. Sebagai contoh, A. franciscana dari benua Amerika telah diperkenalkan secara meluas ke tempat-tempat di luar kawasan asalnya dan selalunya mampu mengatasi spesies tempatan seperti A. salina di rantau Mediterranean.[27][28]

Antara spesies yang sangat setempat ialah A. urmiana dari Tasik Urmia di Iran. Spesies tersebut yang pernah mekar telah menurun secara drastik akibat kemarau, menyebabkan ramai khuatir bahawa ia hampir pupus.[29] Walau bagaimanapun, populasi kedua spesies ini baru-baru ini ditemui di Tasik Masin Koyashskoye di Semenanjung Krimea. [30]

Spesies A. monica terdapat di Tasik Mono, California. Pada tahun 1987, Dennis D. Murphy dari Universiti Stanford mengemukakan petisyen kepada Perkhidmatan Ikan dan Hidupan Liar Amerika Syarikat untuk menambah A. monica ke dalam senarai spesies terancam di bawah Akta Spesies Terancam (1973). Pengalihan air oleh Jabatan Air dan Kuasa Los Angeles mengakibatkan Tasik Mono mengalami kenaikan pada kemasinan dan kepekatan natrium hidroksida. Walaupun terdapat bertrilion-trilion ekor Artemia di tasik itu, namun petisyen itu menegaskan bahawa peningkatan pH akan membahayakan spesies berkenaan. Ancaman terhadap paras air tasik telah ditangani dengan semakan kepada dasar Lembaga Kawalan Sumber Air Negeri California, dan Perkhidmatan Ikan dan Hidupan Liar AS mendapati pada 7 September 1995 bahawa A. monica tidak terjamin kemasukan ke dalam senarai tersebut.[31]