Pada tahun 1855 beliau berkahwin dengan Mary Everest (anak saudara George Everest), yang kemudiannya menulis beberapa karya pendidikan prinsip suaminya.

The Booles mempunyai lima orang anak perempuan:

• Mary Lucy Margret (1856–1908)[52] yang mengahwini ahli matematik dan pengarang Charles Howard Hinton dan mempunyai empat orang anak: George (1882–1943), Eric (*1884), William (1886–1909)[53] dan Sebastian (1887–1923) pencipta Jungle gym. Sebastian mempunyai tiga orang anak:
  • Jean Hinton (nama nikah Rosner) (1917–2002) aktivis kedamaian.
  • William H. Hinton (1919–2004) melawat China pada zaman 1930an dan 40an dan menulis keterangan berpengaruh pembaharuan tanah Komunis.
  • Joan Hinton (1921–2010) bekerja untuk Projek Manhattan dan tinggal di China dari 1948 hingga kematiannya pada 8hb Jun 2010; dia berkahwin dengan Sid Engst.
• Margaret, (1858 – 1935) berkahwin dengan Edward Ingram Taylor, seorang artis.
  • Anak lelaki sulung mereka Geoffrey Ingram Taylor menjadi seorang ahli matematik dan seorang Felo Royal Society.
  • Anak lelaki bongsu mereka Julian adalah seorang profesor pembedahan.
• Alicia (1860–1940), yang membuat sumbangan penting pada geometri empat dimensi
• Lucy Everest (1862–1904), profesor kimia wanita pertama di England
• Ethel Lilian (1864–1960), yang berkahwin dengan saintis dan perevolusi Poland Wilfrid Michael Voynich dan pengarang novel The Gadfly.