Nama Waruṇa berasal daripada sebutan vṛ ("liput, tutup" atau "tahan, ikat") dengan imbuhan -uṇa-, dan bermaksud "yang meliputi atau mengikat", seperti laut atau sungai yang meliputi Bumi, tetapi juga merujuk kepada "terikat" kepada hukum alam atau Rita.[5]

Georges Dumézil (1934) membuat kaji selidik berkenaan identiti Waruna dan dewa Yunani Ouranos pada taraf budaya Indo-Eropah awal.[9][10]Pengecaman asal nama Ouranos dengan Waruna dalam Sanskrit berdasarkan perkataan asal Proto-Indo-Eropah *ŭer yang bermakna "mengikat" – dewa Waruna mengikat yang terhina, dewa Yunani Ouranos mengikat bangsa Siklop. Walaupun pengusulan nama Waruna tidak dinafikan, pengusulan Ouranos ditolak dan perkataan asal *wers- "lembap, titis" digunakan (Sanskrit vṛṣ "hujan, curah").[11]