Terdapat beberapa variasi kontena untuk jenis kargo yang berlainan seperti kontena pendingin untuk kargo mudah rosak, tangki untuk cecair, unit buka atas untuk muatan tinggi, dan kontena boleh lipat. Terdapat juga kontena pembawa arang batu, dan "gerabak sampah" (bin-liners) (kontena yang direka untuk mengangkut sampah melalui jalan/landasan keretapi dari bandar ke pusat kitar semula atau tapak buangan dengan efisyen) yang digunakan di Eropah.

Jenis kontena:[4]

• ISO boleh lipat (Collapsible ISO)
• Kontena rak rata boleh lipat (flushfolding flat-rack containers) untuk barangan berat, barangan pukal separa siap, dan kargo luar saiz (out of gauge) (lebih besar, lebih lebar, lebih panjang).
• Kontena tangki gas
• Kontena penjana
• Kontena van kering (dry van) kegunaan umum untuk kotak, karton, bekas, guni, bandela, palet dan tong.
• Kontena palet lebar kiub tinggi (high cube palletwide) untuk palet EURO.
• Kontena penebat
• Kontena pendingin untuk barangan mudah rosak
• Kontena pukal (bulktainers) buka atas untuk mineral pukal dan mesin berat.
• Kontena buka tepi untuk palet luar saiz.
• Pelantar atau bantalan untuk tong, dram kabel, kargo luar saiz, mesin, dan balak
• Kontena lantai beroleng (rolling floor) untuk kargo yang sukar dikendalikan seperti telur, barangan kaca.
• Kontena tukar badan (swapbody)
• Kontena tangki untuk cecair pukal dan barangan berbahaya
• Kontena berudara untuk produk organik yang memerlukan pengudaraan.